临床学院成立于2012年7月，前身是2004年设立的临床专业管理分部。临床医学专业是新乡医学院三全学院成立之初而设立的唯一专业，2013年被评为河南省“专业综合改革试点”，2017年被评为河南省民办高校品牌专业，生源质量逐年提升，录取分数线居省内同类院校首位，现有在校生7246人。
学院现有专任教师233名，其中正高级职称83名，副高级职称99人，中级职称14人，高级职称占78.1%。近年来，学院教师积极开展信息化教学改革，取得丰硕成果，获得全国教育教学信息化大赛一等奖12项、二等奖26项、三等奖44项，全国多媒体课件大赛一等奖2项、二等奖8项、三等奖9项，河南省教育信息化成果奖一等奖3 项、二等奖6项，河南省教育信息技术一等奖1项、二等奖9项，荣获河南省教育科学研究优秀成果二等奖2项，河南省本科教育线上教学优秀课程三等奖2项。
学院拥有现代化的临床技能培训中心，为临床医学专业学生实践技能培养奠定了坚实的基础。临床技能培训中心还承担了河南省国家住院医师规培、卫生系统转岗、全科助理医师规培等重大考试任务，为全省卫生发展提供支持。
临床学院坚持为国育才为党育人的初心和使命，秉承“立德，强能，求真，济生”的院训，始终致力于以培养“医德医风正、专业知识实、临床技能强”的基层医疗人才，深化“医教协同”育人模式改革，构建“3+1+1”一体化人才培养模式，开展“上午病房，下午课堂”的全过程教学，牢固树立“早临床、多临床、反复临床”的教育理念，突出与岗位胜任力衔接、与全科医师规培衔接、与执业医师考试衔接的“三衔接”育人导向，培养新时代具有救死扶伤的道术、心中有爱的仁术、知识扎实的学术、本领过硬的技术、方法科学的艺术“五术”医学人才。截止目前，学院毕业生总数达到35725人，首次执业医师通过率逐年提升，2018年技能考试通过率达90.71%，位列河南省第二名。